校级实体化运行科研机构
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- 先进材料实验室
- 上海数学中心
- 类脑人工智能科学与技术研究院
- 大数据研究院
- 大气科学研究院
- 微纳电子器件与量子计算机研究院
- 人类表型组研究院
- 智能机器人研究院
- 代谢与整合生物学研究院
- 复杂体系多尺度研究院
- 智能复杂体系基础理论与关键技术实验室
- 国家集成电路创新中心
- 芯片与系统前沿技术研究院
- 新一代集成电路技术集成攻关大平台
- 计算物质科学研究所
- 光电研究院
- 人工智能创新与产业研究院
- 金融科技研究院
- 图书馆/中华古籍保护研究院
- 纤维电子材料与器件研究院（筹）
- 智慧纳米机器人与纳米系统国际研究院（筹）
- 应用数学中心（筹）
- 空间互联网研究院（筹）
- 感染与健康研究院（筹）
- 光纤研究中心（筹）
- 理论物理与信息科学交叉中心（筹）
- 先进计算系统研究院（筹）
- 可信具身智能研究院（筹）
- 脑智研究院（筹）
- 纳米研究院（筹）
- 计算力学与人工智能交叉研究院（筹）
- 未来能源高等研究院（筹）
- 感染与健康研究院（筹）
- 保险应用创新研究院（筹）
- 生物技术学院
- 学敏高等研究院（筹）
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